Applied Biosystems™ TaqMan™ Copy Number Reference Assay, mouse, Tfrc

Beschreibung

TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays für Mäuse werden mit vorgefertigten, Custom Plus und Custom TaqMan™ Kopienzahl-Assays in einer Duplex-Echtzeit-PCR-Reaktion durchgeführt, um Variationen in der Kopienzahl im Genom von Mäusen nachzuweisen und zu messen. TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays für Mäuse sind auch mit dem gängigen Vektor-Marker und Reportergen vorgefertigter TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays kompatibel. Es gibt zwei Optionen für Gene, die als endogene Referenzgene bei Mäusen genutzt werden können: TFRC und TERT. TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays sind für die Erfassung einzigartiger genomischer Sequenzen im Referenz-Genom von Mäusen ausgelegt (NCBI Build 37/mm9) und sind für die relative Quantifizierung von Zielsequenzen mit niedriger Kopienzahl erforderlich.

TaqMan™ Kopienzahl-Assays quantifizieren das Gen von Interesse und normieren auf ein endogenes Referenz-Gen, das bekanntermaßen in einem diploiden Genom in zwei Kopien vorliegt. Bitte beachten Sie, dass TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays artenspezifisch sind.

TFRC: Die Option für Standard-Referenz-Gene
TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays verfügen über eine VIC™ Farbstoff-markierte TAMRA™ Sonde und Sequenz-spezifische Vorwärts- und Rückwärtsprimer. Die Assays sind nicht Primer-begrenzt.

Der TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assay, Maus, TFRC, wird als Standard-Referenz-Assay für die Kopienzahl-Analyse bei Mäusen empfohlen. Dieser Assay weist das Transferrin-Rezeptor-Gen (TFRC) auf Chromosom 16, Zytoband 16qB3, nach. Die Assay-Lokalisierung ist Chr.16:32626732 auf NCBI Build 37. Er hat ein 91 bp-Amplikon, das sich innerhalb des Exon 17 des TFRC-Gens befindet.

Der TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assay, Maus, TERT, ist ein alternatives Referenz-Assay. Es wird für den Fall empfohlen, dass das TFRC-Assay aufgrund von Chromosomenaberrationen oder anderen Problemen mangelhaft verläuft. Der Assay zielt auf das Telomerase-Reverse-Transkriptase-(TERT)-Gen auf Chromosom 13, Zytoband 13qC1 ab. Die Assay-Lokalisierung ist Chr.13:73778992 auf NCBI Build 37. Er hat ein 96 bp-Amplikon, das sich innerhalb des Intron 8 des TERT-Gens befindet.

Der einfachste Arbeitsablauf auf dem Markt
TaqMan™ Kopienzahl-Assays bieten den einfachsten Arbeitsablauf aller derzeit erhältlichen CNV-Analysemethoden. Der Test-Assay (FAM™ Farbstoff-markiert), der Referenz-Assay (VIC™ Farbstoff-markiert), Ihre Proben-DNA und TaqMan™ Master Mix werden kombiniert und laufen dann auf einem Applied Biosystems™ Echtzeit-PCR-System mit dem standardmäßigen TaqMan™ Kopienzahl-Assay-Protokoll. Im Durchschnitt dauert es von der Einrichtung bis zur primären Analyse nur 3 bis 4 Stunden (einschließlich ca. 2 Stunden PCR-Lauf).

Leistungsstarke Datenanalysesoftware
Die CopyCaller™ Software wurde speziell für die Datenanalyse beim TaqMan™ Kopienzahl-Assay entwickelt. Diese kostenlose, anwenderfreundliche Software nutzt eine graphische Benutzeroberfläche, die eine mögliche Kopienanzahl einer Probengruppe schnell und in einem Durchlauf berechnet. Sie gibt außerdem einen Konfidenzwert für jede Kopienzahl und hat eine Ausreißer-Funktion.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für therapeutische oder diagnostische Zwecke bei Menschen und Tieren vorgesehen.